新农合（新型农村合作医疗）和城市社保（通常指城镇职工基本医疗保险）之间存在以下主要区别：
- 参保对象 ：
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新农合 ：主要针对农村户口的农村居民。
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城市社保 ：主要针对城镇户口的在职职工或城镇居民。
- 缴费标准 ：
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新农合 ：由个人、集体和政府多方筹资，个人缴费为主，政府给予一定补贴，按年缴纳。
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城市社保 ：由用人单位和职工共同承担，按照规定的缴费基数和比例按月缴纳。
- 使用范围 ：
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新农合 ：主要用于住院报销，少部分城市看病就诊也能报销。
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城市社保 ：覆盖挂号、看病就医、药店买药、住院治疗报销等多个方面。
- 报销比例 ：
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新农合 ：报销比例相对较低，一般为50~70%，异地报销可能更低，为30~40%。
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城市社保 ：报销比例较高，尤其是城镇职工医保，报销比例一般为70~90%。
- 参保年限 ：
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新农合 ：没有设定具体的参保年限，只要缴费即可享受报销待遇。
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城市社保 ：养老保险需要连续缴纳满15年，医疗保险男性需满25年，女性需满20年。
- 基金管理和使用 ：
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新农合 ：基金由各级政府和相关部门负责，实行专款专用。
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城市社保 ：基金由社会保险经办机构负责，实行严格的财务管理制度和审计监督。
- 系统管理 ：
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新农合 ：由卫生局业务管理。
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城市社保 ：属于社保系统管理。
综上所述，新农合和城市社保在参保对象、缴费标准、使用范围、报销比例、参保年限、基金管理和系统管理等方面存在显著差异。建议根据个人户籍、就业状况和需求选择合适的保险类型。