城乡医疗保险和新农合的主要区别体现在以下几个方面：
- 参保对象 ：
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城乡医疗保险 ：覆盖城镇户口的居民，包括没有参加城镇职工医疗保险的城镇未成年人和没有工作的人群。
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新农合 ：主要针对农村户口的居民，必须以家庭为单位整户参保。
- 管理部门 ：
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城乡医疗保险 ：主要由人社部门管理。
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新农合 ：多数地方由卫生部门管理。
- 购买方式 ：
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城乡医疗保险 ：非农业户口的居民购买。
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新农合 ：农村户口的居民购买。
- 报销比例 ：
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城乡医疗保险 ：报销比例通常为85%，根据不同等级的医院有所不同。
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新农合 ：报销比例在10%-80%不等，具体比例根据医院等级和药品目录有所不同。
- 报销药品 ：
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城乡医疗保险 ：可报销的药品目录较广。
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新农合 ：可报销的药品目录相对较少，且在市级及以上医院的报销比例较低。
- 保障待遇侧重点 ：
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城乡医疗保险 ：主要保障住院和门诊大病，兼顾普通门诊，因此住院及门诊大病待遇较高。
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新农合 ：主要侧重于保障农民在乡镇卫生院的医疗需求，门诊待遇水平相对较高。
- 缴费标准 ：
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城乡医疗保险 ：由个人和政府共同缴纳，缴费标准较为统一。
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新农合 ：由个人、集体和政府多方筹资，缴费标准具有地域性，且按年缴纳。
- 使用范围 ：
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城乡医疗保险 ：可用于挂号、看病就医、药店买药、住院治疗报销等。
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新农合 ：目前主要是住院才能报销，少部分城市看病就诊也能报销。
综上所述，城乡医疗保险和新农合在参保对象、保障待遇、管理部门、购买方式、报销比例、报销药品、保障待遇侧重点、缴费标准和使用范围等方面均存在显著差异。目前，新农合已经和城乡居民医疗保险进行了合并，统称为“城乡居民基本医疗保险”。