单位医保卡和农村合作医疗的区别主要体现在以下几个方面：
- 参保对象不同 ：
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单位医保 ：针对的是用人单位在职职工和灵活就业人员，包括城镇在岗职工和灵活就业人员。
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农村合作医疗 （简称新农合）：主要针对农村居民，必须是农村户口才能参加。
- 缴费主体和方式不同 ：
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单位医保 ：由用人单位和职工共同按月缴纳，缴费基数是上年度本人的平均月薪，单位和个人分别承担一定比例。
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新农合 ：由农民个人每年自愿缴费，政府组织、农民自愿参加，个人、集体和政府多方筹资。
- 报销比例和范围不同 ：
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单位医保 ：报销比例和范围较广，覆盖城镇职工的基本医疗需求，包括门诊、住院和大病医疗等。
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新农合 ：报销比例和范围相对较低，主要保障农民的基本医疗需求，以大病统筹为主，小病由农民自己承担。
- 待遇和保障期限不同 ：
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单位医保 ：在达到退休年龄并满足当地医保退休年限要求后，可以终身享受免费医保待遇。
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新农合 ：没有退休政策，需要终身缴费，保障期限为一年。
- 包含项目不同 ：
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单位医保 ：属于社保的一部分，包含医疗保险、养老保险、失业保险、工伤保险和生育保险。
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新农合 ：只包含医疗保险。
综上所述，单位医保和新农合在参保对象、缴费主体和方式、报销比例和范围、待遇和保障期限以及包含项目等方面都有明显的区别。建议根据个人身份和需求选择合适的医疗保险类型。