农村合作医疗停保需要准备以下材料：
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身份证 ：用于证明参保人的身份信息。
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户口本 ：用于证明参保人的户籍信息。
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农村合作医疗证 ：用于证明参保人的参保状态。
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停止协议 ：在申请停止参加农村合作医疗时，需要签署停止协议，并向工作人员说明停止的原因和具体时间。
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缴费证明 ：如缴费票据、电子缴费记录截图等，方便工作人员查询参保历史。
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特殊人群证明材料 ：如低保户、五保户、残疾人等，需提供相应的证明材料，如低保证、五保证、残疾证等，以享受政府的参保补贴政策。
建议提前咨询当地社保局或相关部门，了解具体的停保流程和所需材料，以确保办理过程顺利。