农合停保可以通过以下几种方式进行申请：
- 通过线上平台办理 ：
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下载并登录国家医保服务平台APP。
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点击底部菜单“地方专区”。
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选择历史缴纳过新农合的地区。
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点击“城乡居民暂停参保”。
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按照提示办理减员即可。
- 到乡镇（街道）便民服务中心医保窗口办理 ：
- 携带户口簿、身份证至就近乡镇（街道）便民服务中心医保窗口办理停保手续。
- 携带相关材料到村里申请 ：
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携带本人身份证及社保参保缴费凭证，到村里申请填写《注销登记表》。
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将材料交户籍所在地乡镇人社中心归档备案。
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乡镇人社中心按规定在信息系统中断原因栏目中勾选“人员参保企业保险”，进行当年度中断缴费处理，暂停城乡居保缴费。
- 到镇（街道）社保服务中心办理退保手续 ：
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持身份证原件及复印件到镇（街道）社保服务中心办理退保手续。
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镇（街道）社保服务中心将材料报批至县社保中心农保科。
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提供相关证明文件，乡管理机构审核并上报县级保险机构。
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县级保险机构审核材料，核算退还保险金数额。
- 前往户籍所在地的民政大厅办理 ：
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提出申请，由工作人员冻结账户即可。
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乡管理机构要对其有关证明审核，并签署意见，与申请退保者的缴费证、缴费记录卡一起上报县级保险机构。
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县级保险机构要再次对上报来的材料进行审核，对符合退保条件者，要为其核算退还的保险金数额。
- 回户口所在地合作医疗管理机构申请 ：
- 向工作人员提出暂停缴费的申请，工作人员就会对账号进行冻结，然后参保的公民签字确认即办理完成。
建议选择一种最方便的方式进行申请，线上平台办理通常最为快捷，若无法线上办理，则可以选择到最近的乡镇（街道）便民服务中心或社保服务中心办理。