在云南西双版纳，有多家医院可以治疗非典型分枝杆菌性巩膜炎。以下是根据相关排名信息整理出的几家医院：

西双版纳傣族自治州人民医院

• 医院类型：三甲 | 医保 | 综合医院
• 特色：西双版纳州人民医院是集医疗、科研、教学和紧急救援为一体的全州最大唯一一所三级甲等综合性医院，也是昆明理工大学附属医院。

景洪市第一人民医院

• 医院类型：三级 | 医保 | 综合医院
• 成立时间：由原西双版纳农垦医院(三乙)和原景洪市人民医院(二甲)资源整合后于2019年9月成立。

勐腊县人民医院

• 医院类型：二甲 | 医保 | 综合医院
• 成立时间：成立于1954年，为县域内最大的一所集医疗、预防、保健、教学为一体的二级甲等综合性医院。

请注意，以上排名仅供参考，具体选择哪家医院还需根据患者的具体病情、医院的专科特长、地理位置、交通便利性以及个人实际情况等因素综合考虑。建议患者在选择医院前，可以通过网络、电话咨询或亲自前往医院进行详细咨询，以便做出最适合自己的选择。