云南省红河州治疗巩膜炎的医院推荐如下：
云锡总医院（红河州第三人民医院）
医院等级 ：三级综合医院
科室与医生 ：拥有8个科室，11位医生，综合评分60分
地址 ：红河哈尼族彝族自治州个旧市金湖东路229号
特点 ：作为滇南地区三级甲等肿瘤专科医院，加入云南省重症医学专科联盟，医疗资源整合能力强。
蒙自市人民医院
医院等级 ：二级综合医院
科室与医生 ：7个科室，7位医生，综合评分0分
地址 ：蒙自市
特点 ：综合评分较低，建议优先考虑其他医院。
其他参考医院
云大医院 （昆明市）：三级综合医院，巩膜炎科室医生15位，综合评分933分，但位于昆明市，非红河州内。 - 红会医院 （昆明市）：三级综合医院，巩膜炎科室医生137位，综合评分164分，同样位于昆明市。
建议 ：优先选择云锡总医院（红河州第三人民医院），因其为红河州内三级综合医院且医疗资源丰富。若需更专业的眼科诊疗，可考虑前往昆明市的云大医院或红会医院，但需跨城就医。