民间中医行医证书的发放主要依据《中医医术确有专长人员医师资格考核注册管理暂行办法》等政策文件，以下是相关情况：
证书种类
中医（专长）医师资格证书 ：2017 年颁布的《中医医术确有专长人员医师资格考核注册管理暂行办法》规定，以师承方式学习中医或者经多年实践，医术确有专长的人员，通过省级中医药主管部门组织的中医医术确有专长医师资格考核后，可获得此证书。
中医（专长）医师执业证书 ：取得《中医（专长）医师资格证书》者，向其拟执业机构所在地县级以上地方中医药主管部门提出注册申请，经注册后取得该证书。
发放流程
报名申请 ：符合条件的民间中医需提交国家中医药管理统一申请表、本人有效身份证、中医医术专长综述、至少两名中医类别执业医师的推荐信等材料。
考核 ：省级中医药主管部门组织中医医术确有专长医师资格考核，考核包括医术专长陈述、现场问答、外治技术操作等环节，考核专家会围绕相关病证的疗效评价关键要素进行分析评估并提问，对其医术专长的效果进行现场评定。
证书发放 ：经综合评议后，考核专家对参加考核者作出考核结论，并对其在执业活动中能够使用的中医药技术方法和具体治疗病证的范围进行认定。考核合格者，由省级中医药主管部门颁发《中医（专长）医师资格证书》。
注册执业 ：取得《中医（专长）医师资格证书》者，向其拟执业机构所在地县级以上地方中医药主管部门提出注册申请，经注册后取得《中医（专长）医师执业证书》，即可在注册的执业范围内，以个人开业的方式或者在医疗机构内从事中医医疗活动。
相关政策支持
国家中医药管理局陆续印发了《国家卫生健康委办公厅 国家中医药管理局办公室关于进一步做好中医 (专长) 医师电子化注册管理等工作的通知》《国家中医药管理局综合司关于进一步做好中医 (专长) 医师资格考核和证书发放工作的通知》等文件，以完善中医 (专长) 医师管理制度。
截至 2023 年底，31 个省 (区、市) 和新疆生产建设兵团均组织开展了中医医术确有专长人员医师资格考核，全国 1.3 万人通过了中医医术确有专长人员医师资格考核并获得中医 (专长) 医师资格。