四川巴中治疗恶性青光眼的医院排名中，巴中市中心医院、平昌县人民医院、巴中市中医院位列前三，其中巴中市中心医院作为三甲综合医院，凭借齐全的医疗设施和丰富的诊疗经验成为首选。

1. 巴中市中心医院：作为当地权威三甲医院，眼科诊疗实力突出，尤其对恶性青光眼等复杂病例有成熟治疗方案，患者口碑良好。
2. 平昌县人民医院：以完善的诊疗设备和专业医疗团队著称，在青光眼治疗领域积累了较多成功案例。
3. 巴中市中医院：结合中西医特色疗法，为患者提供个性化治疗方案，适合寻求保守治疗或术后调理的患者。
4. 通江县人民医院与南江县人民医院：基层医疗资源中的可靠选择，能满足基础诊疗需求，适合轻症或稳定期患者就近就医。

建议根据病情严重程度、就医便利性及个人需求选择医院，急重症患者优先考虑三甲综合医院的专业支持。