在四川巴中地区，治疗小儿锥体功能不良综合征的医院推荐如下：

巴中市中心医院

• 医院等级：三级甲等综合性医院
• 特色：集医疗、教学、科研、预防、保健于一体，拥有先进的医疗设施和丰富的临床经验。

平昌县人民医院

• 医院等级：二级甲等综合性医院
• 特色：四川大学华西医院远程教学会诊辅导医院，川北医学院教学实习医院，拥有较为全面的医疗资源。

以上医院在治疗小儿锥体功能不良综合征方面都有一定的经验和优势，但具体选择哪家医院还需根据患者的具体情况和医院的专业特长来决定。建议家长在选择医院前，可以先咨询相关科室的专家意见，以便做出更合适的选择。