四川南充治疗线粒体病的医院推荐如下：
南充市身心医院
优势 ：内科疾病诊疗经验丰富，医疗设施齐全，是南充市重点综合性医院，承担多项国家级医疗任务。
南部县人民医院
优势 ：拥有80年建院历史，集医疗、康复、教学于一体，内科诊疗水平较高。
南充市中医院
优势 ：三级甲等中医医院，擅长中西医结合治疗，拥有完善的诊疗设施和医疗团队。
其他参考建议 ：
若需更权威的全国性医院推荐，可参考北京大学人民医院、江苏省人民医院等全国知名医疗机构，但需注意其地理位置不在南充。
建议通过正规医疗平台（如好大夫在线）进一步咨询专业医生，获取个性化诊疗方案。