在四川自贡地区，治疗棘阿米巴性角膜炎较好的医院主要有以下几家：
自贡市第三人民医院
- 医院简介：自贡市第三人民医院是一所集医、教、研、防为一体的国家三级甲等综合性医院，拥有较为完善的医疗设施和专业的医疗团队。
- 相关科室：眼科。
自贡市第一人民医院
- 医院简介：自贡市第一人民医院是一所历史悠久、技术力量雄厚的三甲医院，拥有丰富的临床经验和先进的诊疗设备。
- 相关科室：眼科，且有专家可提供棘阿米巴性角膜炎的诊疗服务。
以上信息仅供参考，具体选择哪家医院就诊还需根据患者的具体病情、医院的专科特色、地理位置、交通便利性等因素综合考虑。建议患者在选择医院前，可以通过网络、电话咨询或亲自前往医院了解相关信息，以便做出更适合自己的选择。