新生儿住院医保报销比例因地区而异，具体如下：

广州

• 一级医疗机构：起付标准为150元，报销比例为90%。

• 二级医疗机构：起付标准为300元，报销比例为85%。

• 三级医疗机构：起付标准为500元，报销比例为80%。

长沙

• 基层医疗卫生机构：起付标准200元，报销比例85%。

• 一级医疗机构或不设等级医疗机构：起付标准500元，报销比例82%。

• 二级医疗机构：起付标准800元，报销比例80%。

• 三级医疗机构：起付标准1200元，报销比例65%。

• 省部属医疗机构：起付标准2000元，报销比例60%。

许昌

• 乡级医疗机构：起付标准100元，报销比例90%。

• 县级医疗机构：起付标准300元，报销比例80%。

• 市级医疗机构：起付标准500元，报销比例70%。

• 省级及以上医疗机构：起付标准1000元，报销比例60%。

重庆

• 一级医疗机构：报销比例为75%~80%。

• 二级医疗机构：报销比例为55%~60%。

• 三级医疗机构：报销比例为35%~40%。

成都

• 乡镇卫生院以及社区卫生服务中心：报销比例为95%。

• 一级医疗机构：报销比例为85%。

• 二级医疗机构：报销比例为75%。

• 三级医疗机构：报销比例为60%。

武汉

• 一级医疗机构：报销比例为80%。

• 二级医疗机构：报销比例为70%。

• 三级医疗机构：报销比例为60%。

上海

• 一级医疗机构：报销比例为70%。

• 二级医疗机构：报销比例为60%。

• 三级医疗机构：报销比例为50%。

济南

• 省部三级医疗机构：起付标准1000元，报销比例55%。

• 其他三级医疗机构：起付标准1000元，报销比例65%。

• 二级医疗机构：起付标准400元，报销比例75%。

• 一级医疗机构、社区医疗机构：起付标准400元，报销比例85%。

• 乡镇卫生院：起付标准200元，报销比例90%。

建议您咨询当地的社保部门或医保经办机构，以获取最准确的信息。