甲状腺穿刺一般可以选择以下几种医院：
综合医院
三级甲等综合医院：如北京协和医院、四川大学华西医院、上海交通大学医学院附属瑞金医院、浙江大学医学院附属第一医院等。这些医院通常具有先进的医疗设备和专业的医疗团队，能够提供全面的甲状腺疾病诊断和治疗服务，其病理科、超声科等相关科室的配合也较为紧密，可以确保甲状腺穿刺的准确性和安全性。
其他具备资质的综合医院：一些二级甲等或当地的综合医院，如果其超声科或外科等科室具备开展甲状腺穿刺的条件和技术，也可以进行甲状腺穿刺。但相对来说，其技术水平和经验可能不如大型三甲医院。
专科医院
甲状腺专科医院：如成都京东方医院等，这些医院专注于甲状腺疾病的诊断和治疗，通常拥有专业的甲状腺穿刺团队和先进的设备，能够为患者提供更加专业和个性化的服务。
肿瘤专科医院：对于怀疑甲状腺肿瘤的患者，可以选择肿瘤专科医院进行甲状腺穿刺。这些医院在肿瘤的诊断和治疗方面具有丰富的经验和技术优势，能够更好地评估甲状腺结节的性质，并制定相应的治疗方案。
中医医院
部分中医医院也开展了甲状腺穿刺项目，如成都中医肿瘤医院。这些医院通常会结合中医的辨证论治理念，为患者提供更加全面的治疗方案。