新疆吐鲁番地区治疗婴幼儿型内斜视的医院推荐如下：
推荐医院及优势：
乌鲁木齐普瑞眼科医院
作为正规二级眼科机构，隶属于普瑞眼科连锁，擅长斜视矫正手术，技术成熟，适合婴幼儿斜视治疗。
爱尔阿迪娅眼科医院
专业眼科连锁机构，提供个性化屈光矫正方案，包括角膜塑形镜、全飞秒激光等，注重儿童斜视的早期干预和双眼立体视功能建立。
注意事项：
婴幼儿斜视治疗需优先选择具备儿童眼病诊疗经验的医院，建议提前咨询医院是否开展弱视筛查和矫正项目。
部分医院（如高昌区人民医院）虽在屈光矫正领域有优势，但搜索结果未明确提及婴幼儿斜视治疗经验，需进一步核实。