深圳市一档与二档医疗保险的主要区别体现在以下几个方面：
- 缴费标准 ：
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一档 ：职工一档社保的缴费比例为个人工资收入的7%（单位缴纳5%，个人缴纳2%），缴费基数上限为32376元，下限为6475元。
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二档 ：职工二档社保的缴费比例为个人工资收入的2%（单位缴纳1.5%，个人缴纳0.5%），缴费基数上限同样为32376元，下限为6475元。
- 就医原则 ：
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一档 ：参保人可以在市内任一定点医疗机构就医，无论是门诊还是住院都非常方便。
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二档 ：参保人需要选定深圳市内1家社康或其他基层医疗机构，享受普通门诊统筹待遇。如果需要前往绑定社康所在的上级医院就医，无需开具转诊单。
- 个人账户 ：
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一档 ：设有医保个人账户，个人和单位缴纳的部分都会划入个人账户，可用于支付本人及其亲属的医疗费用。个人账户的划入标准为缴费基数的2%。
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二档 ：没有个人账户，所有费用均通过统筹基金支付，无法享受个人账户的待遇。
- 门诊统筹报销额度 ：
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一档 ：普通门诊年度支付限额为在职人员年社平工资的6%（约10478.4元），退休人员为7%（约12225.22元）。在二级以上医院和专科医院的限额相应调整为在职人员3%（约5239.2元）。
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二档 ：普通门诊年度支付限额为每年2619.6元。
- 住院报销比例 ：
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一档 ：一级医院报销比例为94%，二级医院为92%，三级医院为90%。
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二档 ：一级医院报销比例为92%，二级医院为91%，三级医院为90%。
- 其他待遇 ：
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一档 ：参保人还可以享受终身免费医保的待遇，并且每月可以返还一定金额到个人账户。
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二档 ：没有终身免费医保的待遇，也没有个人账户返还。
深圳市一档医疗保险在缴费标准、就医原则、个人账户、门诊统筹报销额度、住院报销比例等方面均优于二档医疗保险。对于经常需要就医或对医疗待遇要求较高的参保人，选择一档更为合适。而对于经济条件有限或就医需求较少的参保人，二档医疗保险也是一个经济实惠的选择。