住院两天是否可以报销合作医保，需要根据具体的医保政策和报销条件来确定。一般来说，合作医保的报销主要取决于以下几个因素：

住院起付线

• 起付线标准：不同地区的合作医保有不同的起付线标准。例如，乡镇级医院的起付线一般为200元左右，县级医院为500元左右，市级及以上医院为700-1000元左右。如果住院费用未达到起付线标准，通常不能报销。

• 费用累计：如果住院费用达到起付线标准，超过起付线的部分可以按照规定的报销比例进行报销。

住院报销比例

• 报销比例：合作医保的报销比例因医院级别而异。一般来说，乡镇级医院的报销比例较高，能达到85%左右；县级医院报销比例在70%左右；市级及以上医院报销比例在55%-60%左右。

• 费用分段报销：住院费用超过起付线后，通常会按照费用的不同区间实行分段报销。例如，5000元以下的部分报销65%，5001-10000元的部分报销70%，10001-18000元的部分报销75%。

住院报销范围

• 报销范围：合作医保的报销范围包括住院期间的药费、检查费、化验费、手术费、治疗费、护理费等符合规定的医疗费用。如果住院期间的费用不在报销范围内，也不能报销。

住院报销流程

• 入院登记：患者入院后，应主动出示医保卡或相关证件，医院会将患者信息录入医保系统。

• 出院结算：患者出院时，医院会根据医保政策进行费用结算，医保系统会自动按比例报销符合规定的费用。

综上所述，住院两天是否可以报销合作医保，取决于住院费用是否达到起付线标准、费用是否在报销范围内以及是否符合医保政策的其他规定。如果住院费用达到起付线标准且符合报销范围，即使住院时间较短，也可以报销。