广东惠州治疗系统性红斑狼疮性巩膜炎较好的医院推荐：
- 中山大学附属第三医院：该院风湿免疫科在2021复旦版医院专科榜中排名第8，是全国治疗系统性红斑狼疮的顶尖医院之一。
- 惠州市中心人民医院：作为一所公立综合性三级甲等医院，该院在治疗系统性红斑狼疮方面有丰富的经验，并拥有多位专家。
- 惠州市第三人民医院：该院在治疗系统性红斑狼疮方面也有不错的口碑，并设有专门的风湿免疫科。
医院推荐理由：
中山大学附属第三医院：
- 专科排名：在复旦版医院专科榜中排名靠前，表明其在治疗系统性红斑狼疮方面具有很高的专业水平。
- 医疗资源：作为国家卫健委直管的综合性三级甲等医院，拥有先进的医疗设备和专业的医疗团队。
惠州市中心人民医院：
- 医院等级：公立综合性三级甲等医院，是广东省高水平医院，省级区域医疗中心建设单位。
- 专家团队：拥有多位在系统性红斑狼疮治疗方面有丰富经验的专家，如谭志明主任医师、蔡俊钦副主任医师等。
惠州市第三人民医院：
- 历史传承：惠州历史最悠久的医院，前身可追溯至1927年。
- 学科设置：设有专门的风湿免疫科，拥有多位擅长治疗系统性红斑狼疮的专家，如李冠副主任医师、罗伟军主治医师等。
以上三家医院在治疗系统性红斑狼疮方面都有丰富的经验和专业的团队，患者可以根据自己的具体情况选择合适的医院进行治疗。由于系统性红斑狼疮可能涉及多个器官系统，建议患者在就医时选择具备多学科团队协作能力的医院，以获得全面的治疗方案。