在广东深圳，有多家医院在治疗真菌性角膜炎方面具有较高的声誉和专业水平。以下是根据最新数据整理的医院排名：

深圳市眼科医院

• 特色：三级眼科专科医院，以医疗质量为生命线，诚信经营为经营之本，集医疗、教学、科研为一体。
• 地址：福田区泽田路18号。

深圳市人民医院

• 特色：综合性三级甲等医院，疾病医疗设施齐全，治疗经验丰富。
• 地址：留医部位于罗湖区东门北路1017号。

深圳市第二人民医院

• 特色：集医疗、教学、科研、康复、预防保健和健康教育为一体。
• 地址：总院位于福田区笋岗西路3002号。

北京大学深圳医院

• 特色：拥有多个科室和医生，提供全面的医疗服务。
• 地址：广东省深圳市福田莲花路1120号。

请注意，以上排名仅供参考，具体选择哪家医院还需根据患者的具体病情、医生的建议以及医院的实际治疗情况来决定。建议患者在治疗前进行详细的咨询和检查，以确保获得最适合自己的治疗方案。