农村合作医疗的缴费方式主要有以下几种：
线上缴费
微信缴费：
方法一：通过“我—服务—城市服务—社保—城乡居民医疗保险缴纳”路径，选择所在省份或城市的城乡居民医疗保险，输入参保人身份证号码和姓名，确认缴费编号后按照提示完成缴费。
方法二：以河南省为例，下拉微信页面，搜索“河南税务”小程序，点击居民医疗保险缴费，进行申报缴费、缴费凭证开具。
支付宝缴费：
打开支付宝，通过“市民中心—社保—居民医疗保险缴费”路径进行申报缴费、缴费凭证开具。
公众号缴费：
查询当地是否推出新农合微信缴费，若推出，关注所在地推出的农合公众号，输入个人信息注册，注册成功后，在聊天页面下方点击找到新农合缴费，点击缴纳即可完成缴费。
官网缴费：
登录当地社会保险网上申报服务平台，进入网上自助缴费界面，输入姓名和身份证号码，阅读并接受相关条款后，点击发送短信验证码，输入验证码进行查询，确认信息无误后点击支付完成缴费。
银行APP缴费：
以建设银行为例，打开建设银行APP，点击页面左上角的三条横线登录个人账户，然后点击右下角的“悦享生活”进入相关页面。在“悦享生活”页面中，点击“更多”进入更多页面，然后选择“医保缴费”，输入保单号（即农合卡上的序列号），点击查询账单并按照提示完成缴费。
线下缴费
集中代办点缴费：
城乡居民携带身份证可在工商银行、农业银行、邮储银行、建设银行等银行柜台线下缴费。
银行柜台缴费：
持有效身份证件到各地乡镇（街道办事处）、村（社区）的集中代办点通过河南税务社保费管理客户端办理缴费。
办税服务厅缴费：
持有效身份证件到当地办税服务厅缴费。
其他缴费方式
家庭共济缴费：
参加职工医保的参保人员从个人账户中可给家庭成员代缴居民医保费，通过微信搜索“甘肃省医保公共服务平台”绑定家庭共济，向共济账户划拨金额后可进行缴费。
协议账户扣款：
通过九大合作银行协议账户扣款等方式办理缴费。
以上缴费方式为常见的农村合作医疗缴费方式，具体操作可能会因地区而异，建议在缴费前先了解当地的具体规定和操作流程。