根据相关法律法规和政策，入职检查乙肝五项在一般情况下是不合法的。以下是详细说明：

1. 明确法律依据

• 《就业促进法》：明确禁止用人单位以传染病病原携带者为由拒绝录用劳动者。
• 《传染病防治法》：规定用人单位不得因劳动者是传染病病原携带者而歧视。
• 《关于维护乙肝表面抗原携带者就业权利的意见》（2007年原劳动保障部、卫生部联合发布）：要求用人单位在招聘过程中，除法律明确禁止的岗位外，不得将乙肝病毒血清学指标作为体检标准。

2. 政策背景与具体要求

• 取消乙肝检测项目：根据国家相关规定，用人单位（除军队、武警、公安特警等特殊行业外）不得在入职体检中要求检查乙肝五项，也不得要求提供乙肝检测报告，更不得询问是否为乙肝表面抗原携带者。
• 合法体检范围：体检项目应仅限于与岗位直接相关的健康检查，且需尊重员工的隐私权和平等就业权。

3. 特殊情况下的例外

• 对于涉及公共卫生安全的特殊行业（如医疗、食品加工等），乙肝检查可能被视为必要的职业健康防护措施，但其合法性仍需遵循合法、公正、必要的原则，并明确告知员工检查目的、程序及结果处理方式。

4. 总结

• 在普通岗位上，入职体检中强制检查乙肝五项属于违法行为，侵犯了劳动者的隐私权和就业平等权。
• 特殊行业若需进行乙肝检查，必须符合法律法规的规定，并确保程序的合法性和必要性。

如果您在求职过程中遇到此类问题，可依据相关法律维护自身权益。