济南最好的部队医院有以下几家：
- 济南武警医院 ：
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简介 ：济南武警医院始建于1950年，是一所集医疗、保健、预防、科研、教学为一体的三级甲等医院。
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优势 ：医院环境优美、交通方便，外科中心在胸外科、肺部疾病、食管疾病、纵膈疾病、胸壁疾病、乳腺疾病等方面有显著优势。
- 中国人民解放军第456医院（济南空军医院） ：
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简介 ：医院始建于五十年代，是人民空军的一所大型综合性三级甲等医院，也是山东大学、第四军医大学的教学医院。
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优势 ：医院担负医疗保健任务，同时负责医疗保障工作，承担疑难病的诊治，拥有强大的医疗团队和先进的医疗设备。
- 济南军大医院 ：
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简介 ：济南军大医院追求“疗效第一、患者满意第一、医院品牌第一”的发展目标，是一所现代化特色医院。
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优势 ：医院以“神经元四联修复疗法”驰誉全国，吸引了全国各大医院的专家共同研究学习。
- 济南军区总医院 ：
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简介 ：济南军区总医院前身是山东军区直属医院，现已发展成集医、教、研、预防、保健为一体的超大型现代化综合性“三级甲等医院”。
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优势 ：医院拥有强大的医疗团队和先进的医疗设备，设有多个全军医学专科（专病）中心和军区专科中心，整体医疗水平较高，在国内外享有较高声誉。
- 济南军区八十九医院 ：
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简介 ：济南军区八十九医院普外中心成立于1996年，以门脉高压症外科、脾脏外科、腹腔镜外科及外科危重病为技术龙头和专业特色。
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优势 ：中心创始人黄凤瑞主任医师享有“军中一把刀”称号，在门脉高压症外科和脾脏外科研究方面具有显著成就。
这些医院在各自的领域和专业内都有显著的优势和特色，选择哪家医院取决于患者的具体病情和需求。建议患者在选择医院时，综合考虑医院的专科优势、医疗设备、医生团队以及患者评价等因素。