中山大学医院和南方医院都是 非常优秀的医疗机构 ，具体哪个更好需要根据您的具体需求和偏好来决定。以下是它们的一些比较：
- 复旦版百强医院排名 ：
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中山大学附属第一医院（中山一院）位居广东省内第1。
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南方医科大学南方医院在广东省内排名靠前，知名度较高。
- 眼科专科实力 ：
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中山大学中山眼科中心是国内很有实力的眼科专科医院三甲级别，设备设施先进，医师团队强大。
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南方医科大学南方医院眼科也拥有名正高级和副高级专家医师，设备设施包括波前相差仪、准分子激光和飞秒激光等。
- 综合医院实力 ：
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中山大学附属第一医院（中山一院）在复旦版百强医院中稳居省内第1，显示出其综合实力的强大。
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南方医科大学南方医院在多个榜单中均表现出色，综合实力不容小觑。
- 地理位置 ：
- 中山大学附属第一医院（中山一院）和南方医科大学南方医院都位于广州市，方便患者就诊。
建议
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如果您对眼科有较高需求 ，建议优先考虑中山大学中山眼科中心，因为其在眼科领域的专业性和设备设施方面具有明显优势。
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如果您需要综合性的医疗服务 ，且希望选择在省内排名靠前、知名度较高的医院，中山大学附属第一医院和南方医科大学南方医院都是不错的选择。具体选择哪家医院，可以根据您的地理位置、就诊便利性以及个人对医院特色的偏好来决定。
希望这些信息对您有所帮助!