阴囊上长了一个小肉刺可能是尖锐湿疣、毛囊炎、阴囊湿疹等原因引起，需要针对病因给予治疗措施。

1、尖锐湿疣：是由人乳头瘤病毒感染而引起的性传播疾病，发病原因与不洁的性生活、免疫功能低下有关，病毒入侵后会种植在生殖器官的多个部位，例如阴囊、龟头、冠状沟、阴道口、尿道口、宫颈等，由于早期病变不是特别明显，所以会引起阴囊上长了一个小肉刺，但是伴随着疾病的发展，可出现多个或者成群的大红色小颗粒。症状较轻微的患者可以采取局部用药治疗，比如赛儿茶素软膏、咪喹莫特乳膏等，严重时还可以给予物理治疗，比如电离子治疗、激光治疗、冷冻治疗等。

2、毛囊炎：是以毛囊受累为主的皮肤疾病，发病原因与细菌、病毒、真菌、皮肤损伤、多汗等因素有关，这些因素都可能会导致毛囊受到损害，从而诱发炎症反应，毛囊炎可发生在身体的多个部位，当累及到阴囊时，则会引起阴囊上长一个小肉刺。可以给予局部用药治疗，比如夫西地酸乳膏、莫匹罗星软膏、克林霉素凝胶等，必要时还可选择口服用药，比如特比萘芬片、伊曲康唑分散片等。

3、阴囊湿疹：属于湿疹的一种，发病原因与内部因素、外部因素有关，内部因素多见于遗传因素、免疫功能异常，外部因素多见于精神因素、环境因素、刺激因素等，以丘疹、肿胀、渗出为主要特征，所以会引起阴囊上有一个小肉刺。可以给予外用药物涂抹治疗，比如他克莫司软膏、吡美莫司乳膏等，严重者可以选择口服用药，例如苯海拉明片、氯苯那敏片等。

阴囊上长一个小肉刺的患者，需要做好局部的卫生护理措施，每天可以使用温水清洗阴囊部位，使阴囊部位的清洁和干燥，内裤还要经常换洗，尽量以纯棉舒适版的为主。