肛门有果冻状粘液大多是痔疮、慢性结肠炎、直肠息肉等原因造成的，要针对病因进行治疗。
1.痔疮：是直肠下段或肛管上段的静脉丛异常扩张形成的，会刺激直肠黏膜和肛管皮肤，导致局部的分泌物增多，使肛门有果冻状的粘液流出。一般情况下，可使用高锰酸钾溶液进行坐浴，外用太宁栓进行治疗，同时可配合服用化痔丸和草木犀流浸液片等药物进行治疗。严重者可进行外科手术治疗。
2.慢性结肠炎：是发生在直肠黏膜的一种慢性炎症性病变，会导致直肠黏膜充血和糜烂，分泌物明显增多，从而使肛门有果冻状的粘液流出。患者可使用庆大霉素溶液灌肠，配合服用柳氮磺吡啶等药物进行治疗。
3.直肠息肉：是局部的直肠黏膜异常增生形成的，一方面会导致直肠黏膜充血和水肿，另一方面息肉表面容易发生感染和破裂，从而使直肠黏膜的分泌物增多，导致肛门有果冻状的粘液流出。一般情况下，可在肠镜下进行直肠息肉摘除治疗，能够消除症状。
建议患者到公立医院就诊，进行腹部核磁共振检查和肠镜检查，以明确诊断，在医生的指导下进行规范治疗。
急性痔疮可以吃些消炎药和润肠通便类的药物，常用的消炎药主要有头孢类、青霉素类、喹诺酮类等，常用的润肠通便类的药物主要有槐角丸、痔速宁片、通便灵胶囊等。
肛泰软膏是一种具有清热解毒、消肿止痛、凉血止血、燥湿敛疮等功效的外用中成药，肛泰软膏后更疼了有可能与药效还没有充分发挥有关，也有可能与病情比较严重有关，有可能需要继续用药，也有可能需要联合其他方法进行治疗。
