鼻窦炎分为急性鼻窦炎和慢性鼻窦炎。急性鼻窦炎的治疗原则为根除病因，如治疗鼻息肉、泡性中鼻甲、鼻中隔偏曲等，控制感染，解除通气障碍，预防并发症；慢性鼻窦炎不伴鼻息肉者，首选药物治疗，若病情未改善可考虑手术治疗。而慢性鼻窦炎伴鼻息肉或鼻腔解剖结构异常的患者，首选手术治疗，同时进行药物辅助治疗。鼻窦炎的治疗分为急性期治疗、一般治疗、药物治疗、手术治疗、中医治疗、其他治疗。
急性期治疗：如果有出现高热、眼部发胀发红、流大量脓涕及剧烈头痛，此时需要遵医嘱使用足量、足疗程的抗生素。明确致病菌者，可根据药物敏感试验选用敏感抗生素;明确有厌氧菌感染的患者可同时服用替硝唑或甲硝唑。
一般治疗：患病期间建议清淡饮食，多饮水，保证大便通畅，注意休息。若头痛或局部疼痛剧烈，可适当用镇静剂或镇痛剂；过敏性体质患者，如哮喘、过敏性鼻炎应给予抗过敏药物，牙源性上颌窦炎或全身慢性病患者则要针对性治疗；监测体温和外周血白细胞数目，以评估药物疗效和制定下一步的治疗方案。
药物治疗：急性感染期患者遵医嘱使用足量足疗程的抗生素；鼻塞、脓涕多时，可使用鼻内用减充血剂，有利于鼻腔通气和引流，但是减充血剂使用应小于一周。
手术治疗：目的是切除鼻腔鼻窦不可逆病变，重建鼻腔鼻窦通气引流，促使黏膜炎症的消退，促进黏膜腺体和粘毛清除功能恢复。
中医治疗：以芳香通窍、清热解毒、祛湿排脓为治疗原则，具体有针灸、按摩、推拿、中药内服等方法。
其他治疗：比如局部热敷或者鼻腔冲洗。