试管婴儿和自然怀孕区别在于精子和卵子受精的部位不同，试管婴儿是通过人工的方法将卵子取出，与精子在体外受精，体外培养至三天或者是五天的胚胎后，将胚胎移植入宫腔，让其着床发育。
而自然怀孕是精子通过宫腔、输卵管，在壶腹部与卵子相遇受精，受精卵形成后一边由输卵管输送到宫腔，一边分裂，并且在宫腔里着床发育。所以受精卵最终都需要在宫腔内着床，妊娠并且生长发育至足月，最终自然分娩。
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