导致小便时尿道疼的原因：
一、尿道感染。感染后会出现排尿疼痛，同时伴有尿急、尿频等症状，严重的患者甚至可能伴有发热，或者是肉眼血尿的症状。需要行尿常规检查、尿培养检查来进一步明确诊断，明确诊断后给予抗生素进行治疗。同时嘱咐患者多饮水、多排尿。
第二、尿道内结石。可以造成尿道的慢性刺激性疼痛，排尿时疼痛加重，同时伴有排尿的异常，如排尿分叉、排尿费力。如果结石将尿道完全梗阻，还可以造成无法排尿的情况。需要行尿道镜检查，明确诊断。
第三、如果患者存在不洁的性生活，可能会存在性传播疾病，如淋病、非淋菌性尿道炎，这些也会导致排尿时疼痛的症状。需要通过分泌物行病原学检查，明确诊断。
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