卵巢囊肿包括卵巢的病理性囊肿以及生理性囊肿或者是炎性肿物。
一般卵巢的病理性囊肿发生原因并不是十分清楚，有可能与遗传因素有关，也有可能是其他的原因所导致的。
卵巢的生理性囊肿，通常是在月经的中后期出现，可以是卵巢滤泡囊肿或者是卵巢的黄体囊肿，这些囊肿的原因，通常与卵巢分泌激素有关，大小通常在五厘米以下，一般在月经干净后复查会消失。
炎性的囊肿包括输卵管卵巢囊肿、输卵管积水等，这些囊肿通常是因为盆腔炎症所导致，而输卵管系膜囊肿或者是卵巢冠囊肿，常常是胚胎的遗迹。
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