长期腹泻可以是消化系统疾病，也可以是全身系统疾病引起。
消化系统疾病可见于器质性消化系统疾病患者，如炎症性肠病、胃泌素瘤、自身免性肠炎以及慢性胰腺炎的患者。部分慢性病毒性肝炎出现肝功能不全时，也可以出现慢性腹泻的表现。功能性疾病主要见于腹泻型肠易激综合征的患者。
而全身系统疾病，多见于甲状腺功能亢进及糖尿病的患者。对于出现长期腹泻的患者，应消化科门诊就诊，完善相关必要检查，明确病因后针对性治疗。
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