闭经的原因有以下五种：
一、全身性疾病，主要是消耗性疾病，特有的内分泌疾病。
二、生殖器官不健全或者是发育不良，比如先天性无卵巢或者卵巢发育不全，不能产生雌激素和孕激素，子宫内膜损伤、子宫内膜发育不全等。
三、生殖道下段闭锁、生殖道先天性闭锁或者是后天损伤造成的粘连性闭锁。
四、结核性子宫内膜炎，是由结核杆菌引起的子宫内膜各种损伤，形成瘢痕组织造成闭经。
五、垂体或者下丘脑的功能不正常，影响激素分泌，其中以下丘脑闭经比较常见。
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