女性体内如果存在抗精子抗体的话，抗精子抗体与抗原结合，可形成免疫复合物。抗体与精子表面的抗原结合后，会使精子相互凝集，凝集后的精子运动受限。精子浓度、活力形态和存活时间均会受到影响。阴道分泌的抗精子抗体能使精子凝集制动，阻止精子穿过女性的生殖道。在抗体作用下，精子的活动受到限制，精子不能与卵子结合。
如果卵泡液中或者卵子表面有相关的抗精子抗体的话，精子将无法穿过透明带，将会导致不孕及反复流产的情况。
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