通常情况下，肠镜的时间一般都在十五分钟到二十分钟左右，但是每个患者肠管的生理弯曲都不完全一样。
通常来说，经常有脾曲、肝曲比较难以通过，这两个生理弯曲是比较大的，通过也比较困难，所以对消化科医生和肛肠科医生操作起来是有难度的。但是技术娴熟的医生，通过这两个弯曲的时候患者一般不会有明显的痛苦。
但是乙状结肠冗长的患者，就会增加乙状结肠的生理弯曲，对技术不娴熟的医生操作起来比较困难，通常也会需要护士的帮忙按压腹部，来改变这几个生理弯曲，便于通过。所以综合来看的一般在十五分钟到二十分钟左右就能完成。
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