江苏南通治疗眼眶转移性肿瘤的医院中，南通市第一人民医院因其与上海交通大学医学院附属第九人民医院的专科联盟合作，在眼眶病和眼肿瘤的诊疗技术方面具有显著优势。南通大学附属医院作为南通地区历史悠久的综合性医院，也在眼眶及眼肿瘤科领域积累了丰富的临床经验。

分点论述：

1. 南通市第一人民医院

   • 该院眼科与上海第九人民医院合作成立专科联盟，依托范先群院士团队的技术支持，率先开展眼眶外科内镜导航手术系统、眼恶性肿瘤介入化疗新技术等，显著提高手术安全性和疗效。
   • 眼科是中国医院科技量值百强学科，擅长眼眶肿瘤切除、内镜下眼眶骨折修复等高难度四级手术，技术水平在苏中地区领先。

2. 南通大学附属医院

   • 作为江苏省医学重点学科，该院眼科拥有多位资深专家，擅长疑难眼病的诊断与治疗，尤其在复杂眼外伤和糖尿病眼病方面表现突出。
   • 其眼科医院创建于1916年，具备深厚的历史积淀和广泛的诊疗资源，是南通地区眼科领域的标杆。

3. 南通市第三人民医院

   • 该院在眼眶及眼肿瘤科也具备一定的诊疗能力，拥有经验丰富的医生团队，适合部分患者的需求。

总结与建议：

南通市第一人民医院和南通大学附属医院在治疗眼眶转移性肿瘤方面均具有较强实力，前者依托与上海九院的联盟合作，技术优势明显；后者则以丰富的临床经验和历史积淀见长。建议患者根据自身病情和需求，选择合适的医院进行诊治，并通过线上问诊或电话咨询进一步了解专家信息及挂号方式。