黑龙江治疗强直性脊柱炎及其伴发的葡萄膜炎的医院排名中，综合实力较强的包括牡丹江医学院附属第二医院、黑龙江省眼科医院、哈尔滨医科大学附属第一医院等，这些医院在骨科、风湿免疫科及眼科领域具备专业诊疗优势，尤其擅长中西医结合治疗和复杂病例管理。

1. 牡丹江医学院附属第二医院
   作为三级甲等综合医院，其骨科在强直性脊柱炎诊疗方面经验丰富，医疗设施齐全，同时可协同处理伴发的葡萄膜炎问题，提供一体化治疗方案。

2. 黑龙江省眼科医院
   专注于眼病防治，对强直性脊柱炎伴发的葡萄膜炎有针对性治疗能力，结合风湿免疫科协作，确保眼部并发症得到专业干预。

3. 哈尔滨医科大学附属第一医院
   风湿免疫科技术领先，拥有生物制剂治疗和微创手术能力，适合中重度患者，同时依托综合医院资源可多学科联合诊疗。

4. 牡丹江市中医院
   突出中西医结合特色，通过中药、针灸等传统疗法缓解症状，适合需长期调理的患者，且骨科与眼科协作顺畅。

5. 黑龙江中医药大学附属医院
   强直性脊柱炎专科成熟，注重个体化治疗，结合现代检测技术与传统中医理论，对延缓病情进展效果显著。

提示：患者可根据病情复杂程度、治疗偏好（如手术或保守治疗）及地理位置选择医院，建议优先考虑具备多学科联合诊疗能力的机构。