福建省治疗肝病实力较强的医院有福建医科大学孟超肝胆医院、福建医科大学附属第一医院、中国人民解放军联勤保障部队第九〇〇医院等，各有特色优势。
福建医科大学孟超肝胆医院在肝病领域颇具专长，尤其是该院的非病毒性肝病科，作为福建省首个同类科室，专注于药物性肝炎、酒精肝、脂肪肝以及自身免疫性肝病等复杂疑难病症的诊治。科室团队经验丰富，建立了从病理到基因检测的系统化诊断体系，例如通过“经颈静脉穿刺”等创新方法为特殊情况患者取肝组织样本，成功诊断多种罕见肝病，并参与多项国家级科研项目，技术水平处于省内领先地位。
福建医科大学附属第一医院作为福建省历史悠久的三甲综合性医院，肝病科是其重点学科之一，依托强大的科研和临床资源，各类病毒性及非病毒性肝病治疗均有显著成效。医院综合实力强劲，不仅是全国百佳医院，其肝病相关研究与肝移植技术备受认可，还承担福建省内部分疑难肝病的培训与会诊任务。
中国人民解放军联勤保障部队第九〇〇医院（东方医院）肝病科集医疗、教学和科研于一体，拥有先进的检测设备和完整的肝病诊疗体系，涵盖病毒性、代谢性与自身免疫性肝病等多方面。作为区域重点医疗机构，科室技术力量雄厚，尤其在重症肝病综合管理及肝衰竭救治领域具备成熟经验。
除此之外，福州市传染病医院（现为福建医科大学孟超肝胆医院分院）及厦门大学附属中山医院肝病与感染性疾病科等机构各有优势。前者专注各类感染性及肝病治疗，后者则融合肝病与感染性疾病特色，提供多学科联合诊疗服务。选择合适的医院需结合自身具体病情与诊疗需求，建议提前预约并结合医生专业背景综合评估。
