上海治疗肾病最好的三甲医院是上海交通大学医学院附属瑞金医院，其肾病科是国家教育部重点学科、上海市重点学科，拥有顶尖的医疗团队与先进设施。
上海交通大学医学院附属瑞金医院的肾病科成立于20世纪60年代初，是国家首批硕士、博士学位授予点，科室拥有博、硕士生导师12人，已培养百余名硕博研究生。学科承担60余项国家级及省部级课题，包括973、国家自然科学基金等，在国内外发表论文数百篇，获十余项省部级奖项，是上海交通大学医学院肾脏病研究所的核心依托单位。科室设有临床、病理、实验室及透析中心，2015年在全国医院专科排名中位列第五，上海第一。其特色亚专科包括遗传性肾脏病、肾小管间质疾病及慢性肾脏病（CKD），建立国内最大规模的遗传性肾病资源库及肾小管疾病诊疗体系，年门急诊量19万余人次，长期随访管理620例血透及腹透患者。
上海市第一人民医院肾内科由徐琴君教授于1966年创立，是国内首批开展腹膜透析和血液透析的单位之一。科室为上海市血透质控中心骨干单位，擅长重症疾病血液净化治疗，现拥有3台全自动腹膜透析机及百余台血液净化设备，年腹透及血透患者数量居上海前列，发表多篇高质量论文并获国家级科研奖项，同时作为国家腹膜透析培训示范中心参与行业标准制定。
上海交通大学医学院附属新华医院肾脏科由蒋更如教授领衔，在IgA肾病、膜性肾病等研究领域处于国内领先地位，发表SCI论文百余篇，承担国家及上海市多项重点课题，侧重遗传性肾脏病（如Alport综合征）及终末期肾病心血管并发症的防治，拥有独立的肾功能检测实验室与遗传性肾病数据库。
同仁医院肾功能异常专病门诊依托长宁区肾脏病诊疗中心，侧重早期筛查与联合治疗，提供精准检测项目如ACR、胱抑素C、肾脏MRI等，结合中西医结合方案及MDT多学科协作，为慢性肾脏病患者提供全周期健康管理，门诊安排专业营养师及个案管理师随访，确保患者获得个体化治疗方案与长期病程监控。
慢性肾病患者应优先选择具备多学科协作、科研实力及特色诊疗技术的三级甲等医院，定期肾脏专项检查可显著提升早期诊断率，延缓疾病进展。建议高危人群（如糖尿病、高血压患者）主动至上述医院肾内科筛查，通过规范化管理改善预后。上海三甲医院在复杂肾病（如遗传性、继发性）及尿毒症并发症处理中积累丰富经验，患者可根据具体需求选择擅长亚专科的医院提前预约。
