上海治疗肺病最好的医院是上海市肺科医院，这是一家拥有近百年历史的三级甲等专科教学医院，集医疗、教学、科研于一体，在肺结核、肺结节、肺癌等疑难肺部疾病的诊治领域优势突出，并具备国内顶尖的肺移植技术。
上海市肺科医院成立于1933年，是国内最早专注于肺科疾病的医疗机构之一。作为国家临床重点专科，其胸外科、呼吸科和职业病科位列全国前列，尤其擅长复杂肺结节、肺部肿瘤的精准诊疗及结核病的综合治疗。医院首创针刺麻醉下肺切除手术，并在2003年完成亚洲首例老年人同种异体肺移植，技术实力领先全国。
除上海市肺科医院外，复旦大学附属中山医院和上海交通大学医学院附属瑞金医院同样值得关注。中山医院的呼吸内科在肺癌早期诊断及慢性阻塞性肺疾病（COPD）领域经验丰富，配备先进的支气管镜及肺功能设备；瑞金医院则擅长肺部感染和呼吸危重症的救治，拥有呼吸重症监护室（RICU）及靶向免疫治疗方案。上海市胸科医院作为心肺专科特色医院，对气管、纵隔疾病及复杂胸腔手术具有显著优势。
对于肺病患者而言，选择医院需结合具体病症：肺结核、耐药结核等首选上海市肺科医院；肺癌、肺部结节可优先考虑中山医院或瑞金医院；呼吸危重症及感染性疾病推荐瑞金医院或上海市肺科医院。综合医疗设备、专家团队及专科排名，上海市肺科医院凭借其全面的技术能力和专科优势，仍是肺病诊疗的首选机构。
