特殊病种不一定只能在当地医院办理和就医，参保人员可选择在参保地或异地具备资质的定点医疗机构完成相关手续并享受待遇，且部分地区支持定点医院的多选。
特殊病种（门诊慢特病）的申请和报销在大部分地区支持异地办理，参保人不仅可以在参保地的医院申请，也可选择在异地医院完成相关流程。在参保地办理时，通常需携带医保卡、身份证、病历资料及诊断证明，经过医院初审和专家评审后即可享受待遇。若涉及异地办理，需先备案，凭借选定医院诊断证明及相关表格在参保地医保中心完成备案。异地备案成功后，即可享受相应的门诊慢特病待遇。
在定点医院的选择上，多数地区允许参保人根据自身病情及医院资质灵活选定。以马鞍山市为例，参保人员需选择一至两家二级及以上具备相关专科的医疗机构作为定点医院，但政策允许每年根据病情变化做调整。部分省市如广东省则直接对58个病种实现省内就医无限制，参保人可直接在省内任意定点医疗机构享受门诊报销。而某些特殊病种（如器官移植抗排异治疗）可能需要绑定特定的医疗机构进行治疗。
在定点医院数量限制上，各地政策存在一定差异。南京参保人可选择1家专科医院和3家综合医院作为门诊慢特病待遇享受定点；部分病种如精神病、传染类疾病合并多种门特的情况可同时选择一家综合与一家专科医院；多数地区允许增加定点零售药店以解决购药便利性问题。建议参保人员提前查询当地医保局或医院医保办公布的政策细节，灵活安排定点医院及购药渠道。
总体而言，参保人员完全无需担忧必须在当地医院办理特殊病种的问题。除部分地区及特殊病种有特定医院要求外，大部分情况均已实现跨地区办理及就医。及时办理备案并掌握政策灵活度，可最大程度降低异地就医成本，确保自身权益得到全方位保障。
