顽固性头痛具有一定的遗传倾向，约60%的偏头痛患者有家族史，亲属患病风险比一般人群高3~6倍，家族性偏瘫型偏头痛存在明确的常染色体显性遗传特征，且可能由多基因和环境因素共同作用引发。
顽固性头痛的遗传性与特定基因位点相关，例如19p13区域的电压门P/Q钙通道基因突变，以及1q21和1q31等位点，这些异常外显率的遗传模式可能通过影响脑部神经传导或血管功能而致病。遗传并非唯一因素，内分泌失调（如月经周期雌激素波动）、5-羟色胺等神经递质异常也会加剧发病概率，女性患者更易受激素变化影响。
特定食物与行为可能成为诱发媒介，例如富含酪胺的奶酪、亚硝酸盐腌制品及酒精饮品，但遗传易感性会使个体对这些诱因更敏感。家族性偏头痛患者的后代即使不直接继承致病基因，也可能因相似的生理特质（如代谢或神经敏感性）增加患病可能。中医理论进一步补充认为先天肾精不足或体质虚弱可能构成潜在风险，此类体质受遗传和环境双重塑造。
诊断顽固性头痛时需排除器质性病变，对有家族史者建议长期监测生活习惯与身体指标。尽管遗传背景难以改变，但通过饮食调控、规律作息及针对性治疗（如药物或针灸），即使高风险人群也能显著降低发作频率。若头痛持续超过3个月，务必结合医学检查与个体化干预方案制定管理策略。
