云南玉溪社保基数9000和5000的主要区别体现在‌缴费金额、福利待遇和退休金水平‌三个方面。基数越高，每月缴纳的社保费用越多，但未来可享受的医保报销额度、生育津贴及养老金也更高。具体差异如下：

1. ‌缴费金额差异‌
   以养老保险为例（单位16%/个人8%）：

   • 基数9000：单位月缴1440元，个人月缴720元，合计2160元
   • 基数5000：单位月缴800元，个人月缴400元，合计1200元
     医疗保险、失业保险等其他险种同样按比例差额缴费。

2. ‌医保待遇对比‌

   • ‌门诊报销‌：基数9000的医保个人账户每月划入更多资金（约2.8%-3.5%），5000基数划入金额较少
   • ‌住院报销‌：两者报销比例相同，但9000基数因缴费基数高，年度报销上限更高（通常为当地平均工资6倍）

3. ‌养老金计算影响‌
   养老金=基础养老金+个人账户养老金，其中：

   • 基础养老金与缴费基数直接挂钩，9000基数退休后每月可比5000基数多领约30%-40%
   • 个人账户累计额差异显著（9000基数每月多存320元养老保险个人账户）

4. ‌生育津贴差异‌
   生育津贴按单位平均基数发放：

   • 基数9000：顺产约领5.4万元（158天×9000÷30）
   • 基数5000：顺产约领3万元，差额达2.4万元

建议根据实际收入选择基数档位。高基数更适合长期稳定高收入人群，能显著提升社保福利；短期灵活就业或收入波动大者可选低基数减轻当前负担，但需权衡未来待遇差异。