农村合作医疗在北京门诊可以报销，但需满足一定条件并遵循报销规则。以下是具体说明：

一、报销前提条件

1. 异地就医备案 ：需在参保地办理异地就医备案手续，北京作为异地就医地需提前完成备案。

2. 指定医疗机构 ：仅限国家指定的正规甲等医院（如北京协和医院、北京大学医学部等）就医，非定点机构无法报销。

二、报销比例与规则

1. 普通门诊

   • 起付线 ：不同医疗机构起付线不同（如一级医院50元起付，三级医院1000元起付）。

   • 报销比例 ：一级医院50%，二级、三级医院35%，区中医医院40%（每日封顶40元，年累计限额140元）。

   • 大额门诊 ：普通门诊累计补偿后，市外医院未结报费用按50%纳入，起付线2000元，报销25%（年累计限额2000元）。

2. 特殊疾病门诊

   • 报销比例 ：市内基层医院45%，市级医院35%，转诊至市外医院30%，非转诊市外医院15%。

三、注意事项

• 报销流程 ：需通过医保刷卡实时结报，或年终统一办理大额门诊结报。

• 封顶限制 ：普通门诊年累计封顶140元，大额门诊年累计封顶2000元，住院及特殊病门诊封顶金额根据医疗机构级别不同（如三级医院18万元）。

• 政策差异 ：不同省份报销比例可能不同，建议提前咨询参保地医保部门。

农村合作医疗在北京门诊报销需备案、选择指定医院，并严格遵循起付线、比例及流程规定。