海南琼中社保基数20900元的情况下，扣税金额主要取决于具体的税率和扣除项目。根据现行政策，社保缴费基数为20900元时，个人所得税的计算需要先扣除社保费用，再根据剩余金额适用相应的税率。 以下是详细的扣税计算方法和相关要点：

1. 1.社保缴费计算：社保缴费基数20900元，首先需要根据当地社保政策计算各项社保费用。假设社保缴费比例为：养老保险8%，医疗保险2%，失业保险0.5%，住房公积金12%，则各项费用分别为：养老保险：20900×8%=1672元医疗保险：20900×2%=418元失业保险：20900×0.5%=104.5元住房公积金：20900×12%=2508元总社保费用为：1672+418+104.5+2508=4702.5元
2. 2.应纳税所得额计算：在扣除社保费用后，应纳税所得额为：20900-4702.5=16197.5元根据中国现行的个人所得税税率表，16197.5元适用的税率为20%，速算扣除数为1410元。
3. 3.个人所得税计算：应纳个人所得税为：16197.5×20%-1410=3239.5-1410=1829.5元
4. 4.总扣税金额：总扣税金额为社保费用与个人所得税之和：4702.5+1829.5=6532元
5. 5.其他扣除项目：除了上述社保和个税外，还可能存在其他扣除项目，如职业年金、企业年金等，具体金额需根据个人实际情况和当地政策确定。

海南琼中社保基数20900元的情况下，扣除社保费用和个人所得税后的总扣税金额约为6532元。实际扣税金额可能因个人具体情况和当地政策的不同而有所变化，建议根据实际情况进行详细计算或咨询专业税务顾问。了解这些扣税细节，有助于更好地规划个人财务，确保合规纳税。