海南陵水社保基数为6200元时，个人所得税扣税金额主要取决于多项因素，包括社保缴纳比例、专项扣除、免税额等。以下是详细的计算和分析：

1. 1.社保缴纳比例：在海南陵水，社保缴纳比例是固定的。根据现行规定，养老保险个人缴纳比例为8%，医疗保险个人缴纳比例为2%，失业保险个人缴纳比例为0.5%。社保个人缴纳总额为6200元×(8%+2%+0.5%)=6200元×10.5%=651元。
2. 2.应纳税所得额计算：计算应纳税所得额。应纳税所得额=工资收入-五险一金-免征额。目前，中国个人所得税的免征额为5000元。应纳税所得额=6200元-651元-5000元=549元。
3. 3.税率和速算扣除数：根据中国现行的个人所得税税率表，应纳税所得额在0至3000元之间的税率为3%，速算扣除数为0。549元的应纳税所得额对应的个人所得税为549元×3%=16.47元。
4. 4.专项附加扣除：如果个人有符合规定的专项附加扣除（如子女教育、继续教育、大病医疗、住房贷款利息、住房租金、赡养老人等），可以在计算应纳税所得额时扣除。例如，如果每月有1000元的住房租金扣除，那么应纳税所得额将进一步减少至549元-1000元=-451元。这种情况下，个人所得税为0元。
5. 5.综合以上计算，如果仅考虑基本社保和免征额，海南陵水社保基数为6200元时，个人所得税约为16.47元。如果有专项附加扣除，实际扣税金额可能更低，甚至为0元。具体扣税金额还需根据个人实际情况进行详细计算。

海南陵水社保基数为6200元时，个人所得税的扣税金额因个人情况而异，建议根据自身实际情况进行详细计算和申报，以确保合法合规地享受税收优惠政策。