仅知道社保基数为5900元，无法直接确定扣税金额。个人所得税的计算需要综合多方面因素，以下为你介绍具体计算步骤及所需信息：
计算应纳税所得额
应纳税所得额的计算公式为：应纳税所得额 = 年度综合所得收入额 - 5000元/月×12（基本减除费用） - 专项扣除 - 专项附加扣除 - 依法确定的其他扣除。
其中，社保公积金属于专项扣除项目，但仅知道社保基数5900元，不清楚当地社保和公积金的具体缴纳比例，就无法准确计算出专项扣除金额。以海南为例，目前社保缴纳比例如下（假设公积金缴纳比例为10%，仅为示例）：
- 养老保险：个人缴纳8%，即5900×8% = 472元
- 医疗保险：个人缴纳2%，即5900×2% = 118元
- 失业保险：个人缴纳0.5%，即5900×0.5% = 29.5元
- 住房公积金：假设缴纳比例10%，即5900×10% = 590元
每月专项扣除金额约为472 + 118 + 29.5 + 590 = 1209.5元，一年专项扣除金额约为1209.5×12 = 14514元。
确定其他扣除项目
除了专项扣除外，还有专项附加扣除和依法确定的其他扣除。
- 专项附加扣除：包括子女教育、继续教育、大病医疗、住房贷款利息、住房租金、赡养老人、3岁以下婴幼儿照护等项目，具体扣除金额要根据个人实际情况确定。例如，有一个子女正在接受全日制学历教育，每月可扣除1000元；如果是独生子女赡养一位年满60岁的父母，每月可扣除2000元等。
- 依法确定的其他扣除：包括个人缴付符合国家规定的企业年金、职业年金，个人购买符合国家规定的商业健康保险、税收递延型商业养老保险的支出等。
计算应纳税额
在确定应纳税所得额后，根据个人所得税税率表来计算应纳税额。综合所得适用百分之三至百分之四十五的超额累进税率，具体税率表如下：
| 级数 | 全年应纳税所得额 | 税率（%） | 速算扣除数 |
|---|---|---|---|
| 1 | 不超过36000元的 | 3 | 0 |
| 2 | 超过36000元至144000元的部分 | 10 | 2520 |
| 3 | 超过144000元至300000元的部分 | 20 | 16920 |
| 4 | 超过300000元至420000元的部分 | 25 | 31920 |
| 5 | 超过420000元至660000元的部分 | 30 | 52920 |
| 6 | 超过660000元至960000元的部分 | 35 | 85920 |
| 7 | 超过960000元的部分 | 45 | 181920 |
假设不考虑其他收入，仅有一份工资收入，每月工资5900元，一年收入为5900×12 = 70800元，每月专项扣除1209.5元，一年专项扣除14514元，假设没有专项附加扣除和其他扣除。 全年应纳税所得额 = 70800 - 60000 - 14514 = -3714元，应纳税所得额为负数，无需缴纳个人所得税。
要准确计算扣税金额，你需要提供当地社保和公积金的具体缴纳比例、专项附加扣除信息以及其他扣除项目情况。
