海南琼海社保基数4600元的情况下，个人所得税的扣税金额主要取决于多项因素，包括社保缴费比例、专项扣除以及免税额度等。以下是详细的计算和分析：

1. 1.社保缴费比例：养老保险：个人缴费比例为8%，即4600元×8%=368元。医疗保险：个人缴费比例为2%，即4600元×2%=92元。失业保险：个人缴费比例为0.5%，即4600元×0.5%=23元。住房公积金：假设缴费比例为12%，即4600元×12%=552元。总计社保缴费：368元+92元+23元+552元=1035元。
2. 2.应纳税所得额计算：起征点：目前个人所得税的起征点为5000元。免税额度：包括社保缴费1035元，因此应纳税所得额为4600元-1035元-5000元=-1435元。由于应纳税所得额为负数，因此无需缴纳个人所得税。
3. 3.专项扣除：子女教育：每个子女每月可扣除1000元。继续教育：每月可扣除400元或360元。大病医疗：超过15000元的部分可扣除，最高80000元。住房贷款利息：每月可扣除1000元。住房租金：根据城市不同，每月可扣除800元、1100元或1500元。赡养老人：每月可扣除2000元。这些专项扣除可以在计算应纳税所得额时进一步减少税负。
4. 4.在海南琼海，社保基数为4600元的情况下，由于应纳税所得额为负数，因此无需缴纳个人所得税。实际税负为零，主要是因为社保缴费和起征点的抵扣作用。了解这些细节有助于个人更好地规划财务，确保合理利用各项税收优惠政策。

通过以上分析，可以看出在海南琼海，社保基数4600元的个人在现行税收政策下无需缴纳个人所得税。这一结论对于工薪阶层来说是一个重要的财务规划参考。