广西贵港社保基数为12200元时，个人所得税的扣税金额取决于多个因素，包括社保缴费比例、专项扣除、免税额等。以下是详细的计算和解释：

1. 1.社保缴费计算：养老保险：通常个人缴纳比例为8%，即12200元×8%=976元。医疗保险：个人缴纳比例一般为2%，即12200元×2%=244元。失业保险：个人缴纳比例一般为0.5%，即12200元×0.5%=61元。住房公积金：假设个人缴纳比例为12%，即12200元×12%=1464元。总计社保缴费：976元+244元+61元+1464元=2745元。
2. 2.应纳税所得额计算：免税额：根据现行税法，个人所得税的免税额为5000元。专项扣除：假设没有其他专项扣除项目。应纳税所得额：12200元-2745元-5000元=4455元。
3. 3.个人所得税计算：税率和速算扣除数：根据现行的个人所得税税率表，4455元适用的税率为10%，速算扣除数为210元。个人所得税：4455元×10%-210元=235.5元。
4. 4.最终扣税金额：总扣税金额：社保缴费2745元+个人所得税235.5元=2980.5元。

广西贵港社保基数为12200元时，个人的总扣税金额为2980.5元，其中社保缴费为2745元，个人所得税为235.5元。需要注意的是，具体的扣税金额可能会因个人情况的不同而有所变化，例如是否有额外的专项扣除或其他免税项目。建议根据个人的实际情况进行详细的计算或咨询专业税务顾问以获得准确的扣税金额。