根据2024年最新个人所得税政策，广东深圳地区社保基数为6500元时，扣除五险一金后的应纳税所得额及个税金额如下：
一、应纳税所得额计算
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起征点 ：2024年个税起征点为5000元，因此应纳税所得额 = 工资收入 - 5000元 - 社保公积金扣除额。
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社保公积金扣除比例 ：深圳地区五险一金个人缴纳比例通常为8%-12%，具体比例因单位而异，最低可能为8%。
二、个税计算示例
假设社保公积金个人缴纳比例为8%，则：
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每月扣除金额 = 6500元 × 8% = 520元
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应纳税所得额 = 6500元 - 5000元 - 520元 = 130元
根据税率表，130元属于3%税率区间，速算扣除数为0：
- 应纳税额 = 130元 × 3% - 0 = 3.9元
注意 ：上述计算为理论值，实际个税金额需根据企业具体代扣的社保公积金金额确定。
三、其他说明
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旧政策影响 ：2011年曾将起征点调整为3500元，但2018年已随经济调整提高至5000元，现行税率采用7级超额累进制。
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特殊情况 ：若扣除社保后工资低于5000元，需先扣除五险一金至5000元后再计算个税。
建议通过企业财务部门或税务机关获取具体扣除金额，以确保准确性。
