根据2019年最新个人所得税法规定，河南商丘社保基数为13000元时，扣除五险一金后的个税计算如下：

一、基本计算公式

应纳税所得额 = 工资收入 - 5000元起征点 - 专项扣除（五险一金等）

应纳税额 = 应纳税所得额 × 适用税率 - 速算扣除数

二、具体计算步骤

1. 确定应纳税所得额

   假设扣除五险一金后实得工资为13000元，则： $$应纳税所得额 = 13000 - 5000 = 8000 \text{元}$$

2. 适用税率与速算扣除数

   根据税率表，8000元对应的税率为10%，速算扣除数为210元。 $$应纳税额 = 8000 \times 10% - 210 = 800 - 210 = 590 \text{元}$$

3. 实缴个税与到手工资

   实缴个税为590元，到手工资为： $$13000 - 590 = 12410 \text{元}$$

三、注意事项

• 专项扣除 ：若五险一金扣除金额超过5000元，需用实际扣除额替代5000元起征点。例如，若扣除后应纳税所得额为7000元，则应纳税额为： $$7000 \times 10% - 210 = 490 \text{元}$$

• 其他扣除 ：若存在专项附加扣除（如子女教育、住房贷款等），需在计算时进一步扣除。

四、政策依据

• 起征点 ：2019年改革后，我国个人所得税起征点为每月5000元；

• 税率表 ：采用超额累进税率，10%对应的速算扣除数为210元。

以上计算基于2019年现行税率表，若当地政策有调整，需以最新规定为准。