根据2019年最新个人所得税法规定，河南南阳社保基数为13000元时，扣除五险一金后的个税计算如下：

一、基本计算公式

应纳税所得额 = 工资收入 - 五险一金 - 起征点

应纳税额 = 应纳税所得额 × 税率 - 速算扣除数

实缴个税 = 应纳税额 - 五险一金

二、具体计算步骤

1. 确定起征点

   当前起征点为每月5000元。

2. 计算应纳税所得额

   假设五险一金扣除后净收入为13000元，则：
   $$应纳税所得额 = 13000 - 5000 = 8000 \text{元}$$

3. 应用税率表计算税额

   根据2019年税率表，8000元对应的税率为10%，速算扣除数为210元： $$应交个税 = 8000 \times 10% - 210 = 800 - 210 = 590 \text{元}$$

4. 计算实缴工资 $$实缴个税 = 13000 - 590 = 12410 \text{元}$$

三、注意事项

• 专项扣除 ：若存在专项附加扣除（如子女教育、住房贷款等），需在应纳税所得额中进一步扣除；

• 地区差异 ：目前全国统一起征点为5000元，但部分地区可能存在社保基数调整，建议结合当地最新政策确认。

在社保基数13000元且无其他扣除的情况下，每月需缴纳个税590元，实得工资12410元。